Durante su mandato, cada Gran Maestro tiene como función, entre otras, responder a las cartas que los miembros del Orden le envían, recibirlos para una reunión cuando manifiesten el deseo, supervisar los trabajos realizados en las Logias y demás Organismos Afiliados, presidir las convenciones rosacruces a nivel regional, nacional o internacional, realizar conferencias públicas, dirigir seminarios internos sobre las enseñanzas rosacruces, escribir textos filosóficos o incluso libros, etc. Si se comprueba en algún momento, que el Gran Maestro de una jurisdicción no ejerce correctamente su función, éste es reemplazado por otro que se juzgue más competente. Varias veces ha sucedido que han tenido que ser destituidos Grandes Maestros, sin que por ello se haya visto afectado el funcionamiento de la Orden Rosacruz AMORC, ni el contenido de sus enseñanzas. A este respecto, podríamos decir que “los dirigentes pasan, pero la Orden permanece”.